Με βάση τις οδηγίες του ΕΟΔΥ γίνεται καθημερινά  καθαρισμός όλων των συρμών με πιστοποιημένα υλικά απολύμανσης. Εχουν τοποθετηθεί αντισηπτικά υγρά, γίνεται αλλαγή φίλτρων αέρα ανά μία εβδομάδα σε όλες τις αμαξοστοιχίες και αναρτήθηκαν οδηγίες ατομικής υγιεινής σε όλα τα τραίνα, τόσο  για τους επιβάτες όσο και για το προσωπικό στο οποίο έχουν χορηγηθεί μέσα ατομικής προστασίας και ενημερωθηκε για το πρωτόκολλο αντιμετώπισης ύποπτου ή επιβεβαιωμένου περιστατικού. Σε κάθε αμαξοστοιχία προβλέπεται να υπάρχει χώρος απομόνωσης περιστατικού.